Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC34Q96HJ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC34Q96HJ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC34Q96HJ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC34Q96HJ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC34Q96HJ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC34Q96HJ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC34Q96HJ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC34Q96HJ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC34Q96HJ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC34Q96HJ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC34Q96HJ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC34Q96HJ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC34Q96HJ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC34Q96HJ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC34Q96HJ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC34Q96HJ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC34Q96HJ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC34Q96HJ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC34Q96HJ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC34Q96HJ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC34Q96HJ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC34Q96HJ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC34Q96HJ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC34Q96HJ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC34Q96HJ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC34Q96HJ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC34Q96HJ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC34Q96HJ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC34Q96HJ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC34Q96HJ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC34Q96HJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC34Q96HJ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC34Q96HJ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC34Q96HJ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC34Q96HJ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC34Q96HJ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC34Q96HJ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC34Q96HJ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCDC34Q96HJ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC34Q96HJ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC34Q96HJ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC34Q96HJ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC34Q96HJ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC34Q96HJ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC34Q96HJ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC34Q96HJ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC34Q96HJ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC34Q96HJ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC34Q96HJ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC34Q96HJ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC34Q96HJ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms