Protein–RNA interactions for Protein: Q96C00

ZBTB9, Zinc finger and BTB domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB9Q96C00 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBTB9Q96C00 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBTB9Q96C00 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBTB9Q96C00 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ZBTB9Q96C00 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBTB9Q96C00 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZBTB9Q96C00 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZBTB9Q96C00 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZBTB9Q96C00 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZBTB9Q96C00 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ZBTB9Q96C00 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZBTB9Q96C00 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZBTB9Q96C00 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBTB9Q96C00 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBTB9Q96C00 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZBTB9Q96C00 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZBTB9Q96C00 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ZBTB9Q96C00 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZBTB9Q96C00 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZBTB9Q96C00 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBTB9Q96C00 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZBTB9Q96C00 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZBTB9Q96C00 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZBTB9Q96C00 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZBTB9Q96C00 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZBTB9Q96C00 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZBTB9Q96C00 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZBTB9Q96C00 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZBTB9Q96C00 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZBTB9Q96C00 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZBTB9Q96C00 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZBTB9Q96C00 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZBTB9Q96C00 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBTB9Q96C00 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB9Q96C00 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBTB9Q96C00 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB9Q96C00 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBTB9Q96C00 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBTB9Q96C00 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBTB9Q96C00 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBTB9Q96C00 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB9Q96C00 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB9Q96C00 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBTB9Q96C00 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZBTB9Q96C00 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZBTB9Q96C00 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZBTB9Q96C00 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBTB9Q96C00 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBTB9Q96C00 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZBTB9Q96C00 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBTB9Q96C00 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBTB9Q96C00 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZBTB9Q96C00 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZBTB9Q96C00 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZBTB9Q96C00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms