Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UTP4Q969X6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
UTP4Q969X6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UTP4Q969X6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UTP4Q969X6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UTP4Q969X6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTP4Q969X6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UTP4Q969X6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UTP4Q969X6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
UTP4Q969X6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTP4Q969X6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTP4Q969X6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UTP4Q969X6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UTP4Q969X6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTP4Q969X6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UTP4Q969X6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UTP4Q969X6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTP4Q969X6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTP4Q969X6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTP4Q969X6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
UTP4Q969X6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UTP4Q969X6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UTP4Q969X6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTP4Q969X6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTP4Q969X6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP4Q969X6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP4Q969X6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTP4Q969X6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP4Q969X6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP4Q969X6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTP4Q969X6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTP4Q969X6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UTP4Q969X6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTP4Q969X6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTP4Q969X6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTP4Q969X6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UTP4Q969X6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UTP4Q969X6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UTP4Q969X6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UTP4Q969X6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UTP4Q969X6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTP4Q969X6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UTP4Q969X6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UTP4Q969X6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UTP4Q969X6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UTP4Q969X6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UTP4Q969X6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UTP4Q969X6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTP4Q969X6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UTP4Q969X6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTP4Q969X6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UTP4Q969X6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UTP4Q969X6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UTP4Q969X6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UTP4Q969X6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTP4Q969X6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UTP4Q969X6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UTP4Q969X6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UTP4Q969X6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UTP4Q969X6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UTP4Q969X6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UTP4Q969X6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTP4Q969X6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UTP4Q969X6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTP4Q969X6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UTP4Q969X6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms