Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB8BQ92930 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB8BQ92930 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB8BQ92930 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB8BQ92930 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB8BQ92930 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB8BQ92930 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB8BQ92930 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB8BQ92930 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB8BQ92930 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB8BQ92930 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAB8BQ92930 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAB8BQ92930 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB8BQ92930 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB8BQ92930 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAB8BQ92930 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAB8BQ92930 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAB8BQ92930 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB8BQ92930 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB8BQ92930 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB8BQ92930 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB8BQ92930 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB8BQ92930 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB8BQ92930 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB8BQ92930 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB8BQ92930 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB8BQ92930 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB8BQ92930 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB8BQ92930 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB8BQ92930 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB8BQ92930 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB8BQ92930 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms