Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A6Q92581 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A6Q92581 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A6Q92581 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A6Q92581 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A6Q92581 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A6Q92581 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A6Q92581 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A6Q92581 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A6Q92581 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC9A6Q92581 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A6Q92581 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC9A6Q92581 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC9A6Q92581 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC9A6Q92581 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC9A6Q92581 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC9A6Q92581 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC9A6Q92581 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9A6Q92581 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9A6Q92581 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC9A6Q92581 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC9A6Q92581 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC9A6Q92581 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9A6Q92581 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9A6Q92581 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9A6Q92581 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9A6Q92581 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A6Q92581 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A6Q92581 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A6Q92581 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A6Q92581 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A6Q92581 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A6Q92581 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A6Q92581 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A6Q92581 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A6Q92581 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A6Q92581 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A6Q92581 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A6Q92581 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A6Q92581 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A6Q92581 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A6Q92581 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9A6Q92581 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A6Q92581 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC9A6Q92581 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC9A6Q92581 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC9A6Q92581 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC9A6Q92581 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A6Q92581 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC9A6Q92581 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms