Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD31

CCHCR1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCHCR1Q8TD31 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCHCR1Q8TD31 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCHCR1Q8TD31 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCHCR1Q8TD31 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCHCR1Q8TD31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCHCR1Q8TD31 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCHCR1Q8TD31 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCHCR1Q8TD31 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCHCR1Q8TD31 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCHCR1Q8TD31 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCHCR1Q8TD31 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCHCR1Q8TD31 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCHCR1Q8TD31 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCHCR1Q8TD31 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCHCR1Q8TD31 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCHCR1Q8TD31 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCHCR1Q8TD31 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCHCR1Q8TD31 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCHCR1Q8TD31 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCHCR1Q8TD31 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCHCR1Q8TD31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCHCR1Q8TD31 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCHCR1Q8TD31 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCHCR1Q8TD31 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCHCR1Q8TD31 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCHCR1Q8TD31 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCHCR1Q8TD31 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCHCR1Q8TD31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCHCR1Q8TD31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCHCR1Q8TD31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCHCR1Q8TD31 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCHCR1Q8TD31 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCHCR1Q8TD31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCHCR1Q8TD31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCHCR1Q8TD31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCHCR1Q8TD31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCHCR1Q8TD31 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCHCR1Q8TD31 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCHCR1Q8TD31 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCHCR1Q8TD31 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCHCR1Q8TD31 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCHCR1Q8TD31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCHCR1Q8TD31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCHCR1Q8TD31 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCHCR1Q8TD31 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms