Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSDMBQ8TAX9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GSDMBQ8TAX9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GSDMBQ8TAX9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GSDMBQ8TAX9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GSDMBQ8TAX9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSDMBQ8TAX9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMBQ8TAX9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSDMBQ8TAX9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GSDMBQ8TAX9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMBQ8TAX9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSDMBQ8TAX9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSDMBQ8TAX9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GSDMBQ8TAX9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GSDMBQ8TAX9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMBQ8TAX9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GSDMBQ8TAX9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GSDMBQ8TAX9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GSDMBQ8TAX9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSDMBQ8TAX9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GSDMBQ8TAX9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GSDMBQ8TAX9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GSDMBQ8TAX9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GSDMBQ8TAX9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GSDMBQ8TAX9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GSDMBQ8TAX9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GSDMBQ8TAX9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GSDMBQ8TAX9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSDMBQ8TAX9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GSDMBQ8TAX9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GSDMBQ8TAX9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GSDMBQ8TAX9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSDMBQ8TAX9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GSDMBQ8TAX9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSDMBQ8TAX9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GSDMBQ8TAX9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GSDMBQ8TAX9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GSDMBQ8TAX9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSDMBQ8TAX9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GSDMBQ8TAX9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GSDMBQ8TAX9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSDMBQ8TAX9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSDMBQ8TAX9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSDMBQ8TAX9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GSDMBQ8TAX9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GSDMBQ8TAX9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GSDMBQ8TAX9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GSDMBQ8TAX9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GSDMBQ8TAX9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GSDMBQ8TAX9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GSDMBQ8TAX9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GSDMBQ8TAX9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GSDMBQ8TAX9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms