Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATL2Q8NHH9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATL2Q8NHH9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATL2Q8NHH9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATL2Q8NHH9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ATL2Q8NHH9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATL2Q8NHH9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATL2Q8NHH9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATL2Q8NHH9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATL2Q8NHH9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATL2Q8NHH9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATL2Q8NHH9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATL2Q8NHH9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATL2Q8NHH9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATL2Q8NHH9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATL2Q8NHH9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATL2Q8NHH9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATL2Q8NHH9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATL2Q8NHH9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATL2Q8NHH9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ATL2Q8NHH9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATL2Q8NHH9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATL2Q8NHH9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATL2Q8NHH9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATL2Q8NHH9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATL2Q8NHH9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL2Q8NHH9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATL2Q8NHH9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATL2Q8NHH9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATL2Q8NHH9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATL2Q8NHH9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATL2Q8NHH9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATL2Q8NHH9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATL2Q8NHH9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATL2Q8NHH9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATL2Q8NHH9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATL2Q8NHH9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATL2Q8NHH9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATL2Q8NHH9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATL2Q8NHH9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATL2Q8NHH9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATL2Q8NHH9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATL2Q8NHH9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATL2Q8NHH9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATL2Q8NHH9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATL2Q8NHH9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATL2Q8NHH9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATL2Q8NHH9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATL2Q8NHH9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATL2Q8NHH9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATL2Q8NHH9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATL2Q8NHH9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATL2Q8NHH9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms