Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFQ6

BPIFC, BPI fold-containing family C protein, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFCQ8NFQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFCQ8NFQ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFCQ8NFQ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFCQ8NFQ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFCQ8NFQ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFCQ8NFQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFCQ8NFQ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFCQ8NFQ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BPIFCQ8NFQ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BPIFCQ8NFQ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BPIFCQ8NFQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFCQ8NFQ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BPIFCQ8NFQ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BPIFCQ8NFQ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFCQ8NFQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BPIFCQ8NFQ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFCQ8NFQ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFCQ8NFQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFCQ8NFQ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFCQ8NFQ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFCQ8NFQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFCQ8NFQ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BPIFCQ8NFQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BPIFCQ8NFQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BPIFCQ8NFQ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFCQ8NFQ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BPIFCQ8NFQ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFCQ8NFQ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BPIFCQ8NFQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFCQ8NFQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFCQ8NFQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFCQ8NFQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFCQ8NFQ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFCQ8NFQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFCQ8NFQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BPIFCQ8NFQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BPIFCQ8NFQ6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BPIFCQ8NFQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFCQ8NFQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BPIFCQ8NFQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms