Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYB561D1Q8N8Q1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYB561D1Q8N8Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYB561D1Q8N8Q1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYB561D1Q8N8Q1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYB561D1Q8N8Q1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYB561D1Q8N8Q1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYB561D1Q8N8Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYB561D1Q8N8Q1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYB561D1Q8N8Q1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYB561D1Q8N8Q1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYB561D1Q8N8Q1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYB561D1Q8N8Q1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYB561D1Q8N8Q1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYB561D1Q8N8Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYB561D1Q8N8Q1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561D1Q8N8Q1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYB561D1Q8N8Q1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYB561D1Q8N8Q1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYB561D1Q8N8Q1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYB561D1Q8N8Q1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYB561D1Q8N8Q1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYB561D1Q8N8Q1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYB561D1Q8N8Q1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYB561D1Q8N8Q1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYB561D1Q8N8Q1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYB561D1Q8N8Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYB561D1Q8N8Q1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYB561D1Q8N8Q1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYB561D1Q8N8Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYB561D1Q8N8Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYB561D1Q8N8Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYB561D1Q8N8Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYB561D1Q8N8Q1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYB561D1Q8N8Q1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYB561D1Q8N8Q1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYB561D1Q8N8Q1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYB561D1Q8N8Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYB561D1Q8N8Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYB561D1Q8N8Q1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYB561D1Q8N8Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYB561D1Q8N8Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYB561D1Q8N8Q1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms