Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF182Q8N6D2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF182Q8N6D2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF182Q8N6D2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF182Q8N6D2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF182Q8N6D2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF182Q8N6D2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF182Q8N6D2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF182Q8N6D2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF182Q8N6D2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF182Q8N6D2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF182Q8N6D2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RNF182Q8N6D2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF182Q8N6D2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF182Q8N6D2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF182Q8N6D2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF182Q8N6D2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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