Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EID3Q8N140 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EID3Q8N140 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EID3Q8N140 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EID3Q8N140 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EID3Q8N140 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EID3Q8N140 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EID3Q8N140 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EID3Q8N140 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EID3Q8N140 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EID3Q8N140 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EID3Q8N140 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EID3Q8N140 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EID3Q8N140 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EID3Q8N140 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EID3Q8N140 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EID3Q8N140 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EID3Q8N140 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EID3Q8N140 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EID3Q8N140 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EID3Q8N140 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EID3Q8N140 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EID3Q8N140 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EID3Q8N140 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EID3Q8N140 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EID3Q8N140 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EID3Q8N140 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EID3Q8N140 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EID3Q8N140 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EID3Q8N140 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EID3Q8N140 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EID3Q8N140 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EID3Q8N140 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EID3Q8N140 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms