Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLFQ8IW19 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLFQ8IW19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
APLFQ8IW19 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
APLFQ8IW19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APLFQ8IW19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
APLFQ8IW19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
APLFQ8IW19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APLFQ8IW19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APLFQ8IW19 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APLFQ8IW19 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APLFQ8IW19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
APLFQ8IW19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APLFQ8IW19 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APLFQ8IW19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APLFQ8IW19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APLFQ8IW19 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APLFQ8IW19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APLFQ8IW19 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APLFQ8IW19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APLFQ8IW19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APLFQ8IW19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APLFQ8IW19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APLFQ8IW19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APLFQ8IW19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APLFQ8IW19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
APLFQ8IW19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APLFQ8IW19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
APLFQ8IW19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APLFQ8IW19 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APLFQ8IW19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
APLFQ8IW19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
APLFQ8IW19 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
APLFQ8IW19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APLFQ8IW19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APLFQ8IW19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APLFQ8IW19 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APLFQ8IW19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APLFQ8IW19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APLFQ8IW19 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APLFQ8IW19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APLFQ8IW19 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APLFQ8IW19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APLFQ8IW19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APLFQ8IW19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APLFQ8IW19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APLFQ8IW19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APLFQ8IW19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APLFQ8IW19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APLFQ8IW19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms