Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC71Q8IV32 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC71Q8IV32 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC71Q8IV32 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC71Q8IV32 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC71Q8IV32 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC71Q8IV32 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC71Q8IV32 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC71Q8IV32 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC71Q8IV32 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC71Q8IV32 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC71Q8IV32 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC71Q8IV32 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC71Q8IV32 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC71Q8IV32 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC71Q8IV32 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC71Q8IV32 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC71Q8IV32 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC71Q8IV32 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC71Q8IV32 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC71Q8IV32 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC71Q8IV32 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC71Q8IV32 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC71Q8IV32 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC71Q8IV32 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC71Q8IV32 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC71Q8IV32 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC71Q8IV32 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC71Q8IV32 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC71Q8IV32 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC71Q8IV32 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms