Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS6Q86YV9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS6Q86YV9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS6Q86YV9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS6Q86YV9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS6Q86YV9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS6Q86YV9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HPS6Q86YV9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPS6Q86YV9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS6Q86YV9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS6Q86YV9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS6Q86YV9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS6Q86YV9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HPS6Q86YV9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS6Q86YV9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS6Q86YV9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS6Q86YV9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS6Q86YV9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS6Q86YV9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HPS6Q86YV9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HPS6Q86YV9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HPS6Q86YV9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS6Q86YV9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HPS6Q86YV9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS6Q86YV9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS6Q86YV9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPS6Q86YV9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPS6Q86YV9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS6Q86YV9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS6Q86YV9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS6Q86YV9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HPS6Q86YV9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS6Q86YV9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS6Q86YV9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS6Q86YV9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS6Q86YV9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS6Q86YV9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS6Q86YV9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS6Q86YV9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HPS6Q86YV9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPS6Q86YV9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPS6Q86YV9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS6Q86YV9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS6Q86YV9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS6Q86YV9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS6Q86YV9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS6Q86YV9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS6Q86YV9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS6Q86YV9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS6Q86YV9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS6Q86YV9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms