Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NANOGNBQ7Z5D8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NANOGNBQ7Z5D8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NANOGNBQ7Z5D8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NANOGNBQ7Z5D8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NANOGNBQ7Z5D8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NANOGNBQ7Z5D8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NANOGNBQ7Z5D8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NANOGNBQ7Z5D8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NANOGNBQ7Z5D8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NANOGNBQ7Z5D8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NANOGNBQ7Z5D8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NANOGNBQ7Z5D8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NANOGNBQ7Z5D8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NANOGNBQ7Z5D8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NANOGNBQ7Z5D8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NANOGNBQ7Z5D8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NANOGNBQ7Z5D8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NANOGNBQ7Z5D8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NANOGNBQ7Z5D8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NANOGNBQ7Z5D8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NANOGNBQ7Z5D8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NANOGNBQ7Z5D8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NANOGNBQ7Z5D8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NANOGNBQ7Z5D8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NANOGNBQ7Z5D8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NANOGNBQ7Z5D8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NANOGNBQ7Z5D8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NANOGNBQ7Z5D8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NANOGNBQ7Z5D8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NANOGNBQ7Z5D8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NANOGNBQ7Z5D8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NANOGNBQ7Z5D8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NANOGNBQ7Z5D8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NANOGNBQ7Z5D8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NANOGNBQ7Z5D8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms