Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP77Q6ZQR2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP77Q6ZQR2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP77Q6ZQR2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP77Q6ZQR2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP77Q6ZQR2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP77Q6ZQR2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP77Q6ZQR2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP77Q6ZQR2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP77Q6ZQR2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP77Q6ZQR2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP77Q6ZQR2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP77Q6ZQR2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP77Q6ZQR2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP77Q6ZQR2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP77Q6ZQR2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP77Q6ZQR2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP77Q6ZQR2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP77Q6ZQR2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP77Q6ZQR2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP77Q6ZQR2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP77Q6ZQR2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP77Q6ZQR2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP77Q6ZQR2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP77Q6ZQR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP77Q6ZQR2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP77Q6ZQR2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP77Q6ZQR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP77Q6ZQR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP77Q6ZQR2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms