Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TMCO3Q6UWJ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMCO3Q6UWJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMCO3Q6UWJ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMCO3Q6UWJ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMCO3Q6UWJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMCO3Q6UWJ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMCO3Q6UWJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMCO3Q6UWJ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TMCO3Q6UWJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMCO3Q6UWJ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMCO3Q6UWJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMCO3Q6UWJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMCO3Q6UWJ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMCO3Q6UWJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMCO3Q6UWJ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMCO3Q6UWJ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TMCO3Q6UWJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMCO3Q6UWJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMCO3Q6UWJ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TMCO3Q6UWJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TMCO3Q6UWJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMCO3Q6UWJ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TMCO3Q6UWJ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TMCO3Q6UWJ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TMCO3Q6UWJ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TMCO3Q6UWJ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TMCO3Q6UWJ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TMCO3Q6UWJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TMCO3Q6UWJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TMCO3Q6UWJ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TMCO3Q6UWJ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TMCO3Q6UWJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TMCO3Q6UWJ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TMCO3Q6UWJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TMCO3Q6UWJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMCO3Q6UWJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMCO3Q6UWJ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TMCO3Q6UWJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TMCO3Q6UWJ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMCO3Q6UWJ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMCO3Q6UWJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMCO3Q6UWJ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMCO3Q6UWJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMCO3Q6UWJ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMCO3Q6UWJ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMCO3Q6UWJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMCO3Q6UWJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMCO3Q6UWJ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMCO3Q6UWJ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMCO3Q6UWJ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMCO3Q6UWJ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMCO3Q6UWJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMCO3Q6UWJ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMCO3Q6UWJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMCO3Q6UWJ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMCO3Q6UWJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMCO3Q6UWJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMCO3Q6UWJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMCO3Q6UWJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMCO3Q6UWJ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMCO3Q6UWJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMCO3Q6UWJ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMCO3Q6UWJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMCO3Q6UWJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMCO3Q6UWJ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMCO3Q6UWJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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