Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNIP4Q6PIL6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNIP4Q6PIL6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP4Q6PIL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNIP4Q6PIL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNIP4Q6PIL6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNIP4Q6PIL6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNIP4Q6PIL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNIP4Q6PIL6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNIP4Q6PIL6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNIP4Q6PIL6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNIP4Q6PIL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNIP4Q6PIL6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNIP4Q6PIL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNIP4Q6PIL6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNIP4Q6PIL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNIP4Q6PIL6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNIP4Q6PIL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNIP4Q6PIL6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNIP4Q6PIL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNIP4Q6PIL6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNIP4Q6PIL6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNIP4Q6PIL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNIP4Q6PIL6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNIP4Q6PIL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNIP4Q6PIL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP4Q6PIL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP4Q6PIL6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP4Q6PIL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP4Q6PIL6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP4Q6PIL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP4Q6PIL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNIP4Q6PIL6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNIP4Q6PIL6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP4Q6PIL6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP4Q6PIL6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNIP4Q6PIL6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP4Q6PIL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms