Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf88Q6PI97 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C11orf88Q6PI97 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C11orf88Q6PI97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C11orf88Q6PI97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf88Q6PI97 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C11orf88Q6PI97 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C11orf88Q6PI97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C11orf88Q6PI97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C11orf88Q6PI97 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C11orf88Q6PI97 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C11orf88Q6PI97 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf88Q6PI97 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C11orf88Q6PI97 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C11orf88Q6PI97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C11orf88Q6PI97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C11orf88Q6PI97 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C11orf88Q6PI97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C11orf88Q6PI97 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C11orf88Q6PI97 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C11orf88Q6PI97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C11orf88Q6PI97 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C11orf88Q6PI97 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf88Q6PI97 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C11orf88Q6PI97 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C11orf88Q6PI97 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C11orf88Q6PI97 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C11orf88Q6PI97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C11orf88Q6PI97 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C11orf88Q6PI97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf88Q6PI97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf88Q6PI97 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms