Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDZK1Q5T2W1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDZK1Q5T2W1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDZK1Q5T2W1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZK1Q5T2W1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZK1Q5T2W1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZK1Q5T2W1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZK1Q5T2W1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZK1Q5T2W1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZK1Q5T2W1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZK1Q5T2W1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZK1Q5T2W1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZK1Q5T2W1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZK1Q5T2W1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDZK1Q5T2W1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDZK1Q5T2W1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDZK1Q5T2W1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDZK1Q5T2W1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZK1Q5T2W1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDZK1Q5T2W1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDZK1Q5T2W1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1Q5T2W1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDZK1Q5T2W1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDZK1Q5T2W1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1Q5T2W1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1Q5T2W1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDZK1Q5T2W1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1Q5T2W1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDZK1Q5T2W1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDZK1Q5T2W1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZK1Q5T2W1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZK1Q5T2W1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms