Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNYL2Q5T2Q4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNYL2Q5T2Q4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNYL2Q5T2Q4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNYL2Q5T2Q4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCNYL2Q5T2Q4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNYL2Q5T2Q4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNYL2Q5T2Q4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNYL2Q5T2Q4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNYL2Q5T2Q4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNYL2Q5T2Q4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCNYL2Q5T2Q4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNYL2Q5T2Q4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNYL2Q5T2Q4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYL2Q5T2Q4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNYL2Q5T2Q4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNYL2Q5T2Q4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNYL2Q5T2Q4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNYL2Q5T2Q4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNYL2Q5T2Q4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNYL2Q5T2Q4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNYL2Q5T2Q4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNYL2Q5T2Q4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYL2Q5T2Q4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNYL2Q5T2Q4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNYL2Q5T2Q4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNYL2Q5T2Q4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNYL2Q5T2Q4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNYL2Q5T2Q4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNYL2Q5T2Q4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNYL2Q5T2Q4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNYL2Q5T2Q4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNYL2Q5T2Q4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNYL2Q5T2Q4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNYL2Q5T2Q4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNYL2Q5T2Q4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNYL2Q5T2Q4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNYL2Q5T2Q4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNYL2Q5T2Q4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNYL2Q5T2Q4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNYL2Q5T2Q4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNYL2Q5T2Q4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNYL2Q5T2Q4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCNYL2Q5T2Q4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCNYL2Q5T2Q4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCNYL2Q5T2Q4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms