Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPRED3Q2MJR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPRED3Q2MJR0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPRED3Q2MJR0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPRED3Q2MJR0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPRED3Q2MJR0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPRED3Q2MJR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPRED3Q2MJR0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPRED3Q2MJR0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPRED3Q2MJR0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPRED3Q2MJR0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPRED3Q2MJR0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPRED3Q2MJR0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPRED3Q2MJR0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPRED3Q2MJR0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPRED3Q2MJR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPRED3Q2MJR0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPRED3Q2MJR0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPRED3Q2MJR0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPRED3Q2MJR0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPRED3Q2MJR0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPRED3Q2MJR0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPRED3Q2MJR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPRED3Q2MJR0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPRED3Q2MJR0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPRED3Q2MJR0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPRED3Q2MJR0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPRED3Q2MJR0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPRED3Q2MJR0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRED3Q2MJR0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPRED3Q2MJR0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPRED3Q2MJR0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPRED3Q2MJR0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPRED3Q2MJR0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPRED3Q2MJR0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SPRED3Q2MJR0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPRED3Q2MJR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPRED3Q2MJR0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPRED3Q2MJR0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPRED3Q2MJR0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRED3Q2MJR0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRED3Q2MJR0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRED3Q2MJR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRED3Q2MJR0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRED3Q2MJR0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SPRED3Q2MJR0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRED3Q2MJR0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SPRED3Q2MJR0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPRED3Q2MJR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPRED3Q2MJR0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SPRED3Q2MJR0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPRED3Q2MJR0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPRED3Q2MJR0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPRED3Q2MJR0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms