Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q1T7F1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q1T7F1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q1T7F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q1T7F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q1T7F1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q1T7F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q1T7F1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q1T7F1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q1T7F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q1T7F1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q1T7F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q1T7F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q1T7F1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q1T7F1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q1T7F1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q1T7F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q1T7F1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q1T7F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q1T7F1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q1T7F1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q1T7F1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q1T7F1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q1T7F1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q1T7F1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q1T7F1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q1T7F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q1T7F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q1T7F1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q1T7F1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q1T7F1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q1T7F1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q1T7F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q1T7F1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q1T7F1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q1T7F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q1T7F1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q1T7F1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q1T7F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q1T7F1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q1T7F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q1T7F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q1T7F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q1T7F1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q1T7F1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q1T7F1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q1T7F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q1T7F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q1T7F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q1T7F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q1T7F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q1T7F1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q1T7F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q1T7F1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q1T7F1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q1T7F1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q1T7F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q1T7F1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q1T7F1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q1T7F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q1T7F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q1T7F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q1T7F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q1T7F1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q1T7F1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q1T7F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q1T7F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q1T7F1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q1T7F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q1T7F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q1T7F1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q1T7F1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q1T7F1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q1T7F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q1T7F1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q1T7F1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q1T7F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q1T7F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q1T7F1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q1T7F1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q1T7F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q1T7F1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q1T7F1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q1T7F1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q1T7F1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q1T7F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q1T7F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q1T7F1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q1T7F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q1T7F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q1T7F1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q1T7F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q1T7F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q1T7F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q1T7F1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q1T7F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q1T7F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q1T7F1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q1T7F1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q1T7F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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