Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q1T7F1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Q1T7F1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q1T7F1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q1T7F1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q1T7F1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q1T7F1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q1T7F1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q1T7F1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q1T7F1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q1T7F1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q1T7F1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q1T7F1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q1T7F1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q1T7F1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q1T7F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q1T7F1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q1T7F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q1T7F1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q1T7F1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q1T7F1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q1T7F1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q1T7F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q1T7F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q1T7F1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q1T7F1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q1T7F1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q1T7F1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q1T7F1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q1T7F1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q1T7F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q1T7F1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q1T7F1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q1T7F1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q1T7F1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q1T7F1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q1T7F1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q1T7F1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q1T7F1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q1T7F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q1T7F1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q1T7F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q1T7F1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q1T7F1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q1T7F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q1T7F1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q1T7F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q1T7F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q1T7F1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q1T7F1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q1T7F1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q1T7F1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q1T7F1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q1T7F1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q1T7F1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q1T7F1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q1T7F1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q1T7F1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q1T7F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q1T7F1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q1T7F1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q1T7F1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q1T7F1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q1T7F1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q1T7F1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q1T7F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q1T7F1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q1T7F1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q1T7F1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q1T7F1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q1T7F1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q1T7F1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q1T7F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q1T7F1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q1T7F1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q1T7F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q1T7F1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q1T7F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q1T7F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q1T7F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q1T7F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q1T7F1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q1T7F1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q1T7F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q1T7F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q1T7F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q1T7F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q1T7F1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q1T7F1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q1T7F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q1T7F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q1T7F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q1T7F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q1T7F1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q1T7F1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q1T7F1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q1T7F1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q1T7F1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q1T7F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q1T7F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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