Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NFKBIBQ15653 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NFKBIBQ15653 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NFKBIBQ15653 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NFKBIBQ15653 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NFKBIBQ15653 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NFKBIBQ15653 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NFKBIBQ15653 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NFKBIBQ15653 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NFKBIBQ15653 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NFKBIBQ15653 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NFKBIBQ15653 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NFKBIBQ15653 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NFKBIBQ15653 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NFKBIBQ15653 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NFKBIBQ15653 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NFKBIBQ15653 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NFKBIBQ15653 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NFKBIBQ15653 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NFKBIBQ15653 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NFKBIBQ15653 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NFKBIBQ15653 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NFKBIBQ15653 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NFKBIBQ15653 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NFKBIBQ15653 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NFKBIBQ15653 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NFKBIBQ15653 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NFKBIBQ15653 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NFKBIBQ15653 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NFKBIBQ15653 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NFKBIBQ15653 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NFKBIBQ15653 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NFKBIBQ15653 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NFKBIBQ15653 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NFKBIBQ15653 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NFKBIBQ15653 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NFKBIBQ15653 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NFKBIBQ15653 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NFKBIBQ15653 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NFKBIBQ15653 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NFKBIBQ15653 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NFKBIBQ15653 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NFKBIBQ15653 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NFKBIBQ15653 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NFKBIBQ15653 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NFKBIBQ15653 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NFKBIBQ15653 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NFKBIBQ15653 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFKBIBQ15653 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFKBIBQ15653 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NFKBIBQ15653 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NFKBIBQ15653 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NFKBIBQ15653 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NFKBIBQ15653 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NFKBIBQ15653 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NFKBIBQ15653 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NFKBIBQ15653 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NFKBIBQ15653 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NFKBIBQ15653 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NFKBIBQ15653 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NFKBIBQ15653 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFKBIBQ15653 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NFKBIBQ15653 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NFKBIBQ15653 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NFKBIBQ15653 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NFKBIBQ15653 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NFKBIBQ15653 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NFKBIBQ15653 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NFKBIBQ15653 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NFKBIBQ15653 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NFKBIBQ15653 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NFKBIBQ15653 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NFKBIBQ15653 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NFKBIBQ15653 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NFKBIBQ15653 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NFKBIBQ15653 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NFKBIBQ15653 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NFKBIBQ15653 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NFKBIBQ15653 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NFKBIBQ15653 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NFKBIBQ15653 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NFKBIBQ15653 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NFKBIBQ15653 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NFKBIBQ15653 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms