Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SYCP1Q15431 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYCP1Q15431 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYCP1Q15431 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP1Q15431 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCP1Q15431 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP1Q15431 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP1Q15431 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP1Q15431 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCP1Q15431 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYCP1Q15431 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCP1Q15431 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCP1Q15431 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP1Q15431 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCP1Q15431 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCP1Q15431 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP1Q15431 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP1Q15431 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCP1Q15431 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP1Q15431 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP1Q15431 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP1Q15431 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP1Q15431 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP1Q15431 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP1Q15431 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP1Q15431 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP1Q15431 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP1Q15431 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP1Q15431 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SYCP1Q15431 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCP1Q15431 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP1Q15431 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCP1Q15431 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SYCP1Q15431 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SYCP1Q15431 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP1Q15431 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP1Q15431 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SYCP1Q15431 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYCP1Q15431 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYCP1Q15431 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP1Q15431 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP1Q15431 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP1Q15431 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP1Q15431 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP1Q15431 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP1Q15431 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYCP1Q15431 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYCP1Q15431 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP1Q15431 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP1Q15431 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP1Q15431 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP1Q15431 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP1Q15431 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYCP1Q15431 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYCP1Q15431 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYCP1Q15431 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP1Q15431 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP1Q15431 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP1Q15431 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYCP1Q15431 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYCP1Q15431 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYCP1Q15431 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP1Q15431 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP1Q15431 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
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