Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK1Q13546 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIPK1Q13546 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIPK1Q13546 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIPK1Q13546 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RIPK1Q13546 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIPK1Q13546 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIPK1Q13546 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RIPK1Q13546 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIPK1Q13546 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIPK1Q13546 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIPK1Q13546 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK1Q13546 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIPK1Q13546 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK1Q13546 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK1Q13546 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIPK1Q13546 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIPK1Q13546 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK1Q13546 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK1Q13546 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK1Q13546 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK1Q13546 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK1Q13546 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK1Q13546 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK1Q13546 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIPK1Q13546 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIPK1Q13546 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIPK1Q13546 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIPK1Q13546 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIPK1Q13546 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIPK1Q13546 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RIPK1Q13546 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK1Q13546 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK1Q13546 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIPK1Q13546 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK1Q13546 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIPK1Q13546 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RIPK1Q13546 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RIPK1Q13546 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RIPK1Q13546 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPK1Q13546 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RIPK1Q13546 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RIPK1Q13546 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RIPK1Q13546 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RIPK1Q13546 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RIPK1Q13546 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RIPK1Q13546 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RIPK1Q13546 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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