Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KCNMA1Q12791 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCNMA1Q12791 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCNMA1Q12791 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCNMA1Q12791 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KCNMA1Q12791 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KCNMA1Q12791 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
KCNMA1Q12791 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KCNMA1Q12791 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KCNMA1Q12791 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KCNMA1Q12791 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KCNMA1Q12791 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KCNMA1Q12791 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KCNMA1Q12791 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KCNMA1Q12791 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KCNMA1Q12791 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KCNMA1Q12791 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KCNMA1Q12791 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KCNMA1Q12791 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
KCNMA1Q12791 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNMA1Q12791 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
KCNMA1Q12791 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KCNMA1Q12791 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNMA1Q12791 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNMA1Q12791 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNMA1Q12791 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNMA1Q12791 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCNMA1Q12791 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KCNMA1Q12791 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KCNMA1Q12791 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KCNMA1Q12791 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNMA1Q12791 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCNMA1Q12791 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCNMA1Q12791 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KCNMA1Q12791 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KCNMA1Q12791 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KCNMA1Q12791 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KCNMA1Q12791 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KCNMA1Q12791 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KCNMA1Q12791 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KCNMA1Q12791 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KCNMA1Q12791 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KCNMA1Q12791 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KCNMA1Q12791 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KCNMA1Q12791 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KCNMA1Q12791 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNMA1Q12791 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNMA1Q12791 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KCNMA1Q12791 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
KCNMA1Q12791 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KCNMA1Q12791 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KCNMA1Q12791 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
KCNMA1Q12791 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KCNMA1Q12791 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KCNMA1Q12791 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KCNMA1Q12791 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNMA1Q12791 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNMA1Q12791 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNMA1Q12791 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNMA1Q12791 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
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