Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
REG3AQ06141 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
REG3AQ06141 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG3AQ06141 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG3AQ06141 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG3AQ06141 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
REG3AQ06141 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
REG3AQ06141 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
REG3AQ06141 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
REG3AQ06141 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
REG3AQ06141 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REG3AQ06141 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
REG3AQ06141 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
REG3AQ06141 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms