Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTK2Q05397 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTK2Q05397 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTK2Q05397 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTK2Q05397 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTK2Q05397 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTK2Q05397 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTK2Q05397 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTK2Q05397 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTK2Q05397 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTK2Q05397 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTK2Q05397 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTK2Q05397 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTK2Q05397 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTK2Q05397 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTK2Q05397 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTK2Q05397 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTK2Q05397 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTK2Q05397 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTK2Q05397 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTK2Q05397 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTK2Q05397 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTK2Q05397 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTK2Q05397 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTK2Q05397 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTK2Q05397 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTK2Q05397 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTK2Q05397 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTK2Q05397 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTK2Q05397 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTK2Q05397 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTK2Q05397 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTK2Q05397 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTK2Q05397 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTK2Q05397 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTK2Q05397 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTK2Q05397 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTK2Q05397 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTK2Q05397 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTK2Q05397 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTK2Q05397 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTK2Q05397 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTK2Q05397 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTK2Q05397 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTK2Q05397 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTK2Q05397 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTK2Q05397 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTK2Q05397 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTK2Q05397 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTK2Q05397 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTK2Q05397 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTK2Q05397 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTK2Q05397 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTK2Q05397 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTK2Q05397 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTK2Q05397 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms