Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX1P78414 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX1P78414 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX1P78414 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX1P78414 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX1P78414 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX1P78414 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX1P78414 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IRX1P78414 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX1P78414 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX1P78414 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX1P78414 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX1P78414 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX1P78414 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IRX1P78414 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRX1P78414 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRX1P78414 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IRX1P78414 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IRX1P78414 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRX1P78414 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRX1P78414 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX1P78414 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX1P78414 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRX1P78414 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRX1P78414 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRX1P78414 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX1P78414 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRX1P78414 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRX1P78414 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX1P78414 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRX1P78414 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRX1P78414 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX1P78414 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRX1P78414 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRX1P78414 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRX1P78414 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRX1P78414 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRX1P78414 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRX1P78414 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IRX1P78414 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX1P78414 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX1P78414 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX1P78414 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX1P78414 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX1P78414 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX1P78414 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX1P78414 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX1P78414 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX1P78414 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX1P78414 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX1P78414 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX1P78414 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX1P78414 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX1P78414 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX1P78414 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX1P78414 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX1P78414 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRX1P78414 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRX1P78414 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRX1P78414 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IRX1P78414 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRX1P78414 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX1P78414 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX1P78414 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX1P78414 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX1P78414 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX1P78414 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX1P78414 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX1P78414 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX1P78414 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX1P78414 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX1P78414 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX1P78414 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX1P78414 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX1P78414 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX1P78414 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRX1P78414 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRX1P78414 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRX1P78414 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRX1P78414 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRX1P78414 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRX1P78414 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRX1P78414 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX1P78414 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRX1P78414 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRX1P78414 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX1P78414 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IRX1P78414 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX1P78414 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX1P78414 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX1P78414 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRX1P78414 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX1P78414 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX1P78414 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX1P78414 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX1P78414 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX1P78414 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX1P78414 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX1P78414 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX1P78414 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms