Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVFC1-1P60608 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVFC1-1P60608 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVFC1-1P60608 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVFC1-1P60608 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1-1P60608 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1-1P60608 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1-1P60608 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1-1P60608 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVFC1-1P60608 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1-1P60608 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVFC1-1P60608 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVFC1-1P60608 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVFC1-1P60608 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVFC1-1P60608 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVFC1-1P60608 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1-1P60608 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVFC1-1P60608 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVFC1-1P60608 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFC1-1P60608 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVFC1-1P60608 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFC1-1P60608 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFC1-1P60608 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1-1P60608 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFC1-1P60608 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFC1-1P60608 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVFC1-1P60608 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1-1P60608 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERVFC1-1P60608 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1-1P60608 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms