Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAG2P55895 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAG2P55895 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG2P55895 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAG2P55895 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG2P55895 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG2P55895 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAG2P55895 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAG2P55895 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAG2P55895 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG2P55895 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAG2P55895 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAG2P55895 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAG2P55895 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAG2P55895 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAG2P55895 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG2P55895 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAG2P55895 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAG2P55895 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAG2P55895 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAG2P55895 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAG2P55895 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAG2P55895 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAG2P55895 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAG2P55895 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAG2P55895 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAG2P55895 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAG2P55895 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAG2P55895 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAG2P55895 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAG2P55895 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAG2P55895 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAG2P55895 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG2P55895 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG2P55895 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAG2P55895 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG2P55895 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAG2P55895 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG2P55895 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAG2P55895 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAG2P55895 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAG2P55895 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAG2P55895 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG2P55895 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG2P55895 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAG2P55895 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG2P55895 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAG2P55895 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAG2P55895 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG2P55895 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAG2P55895 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAG2P55895 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAG2P55895 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG2P55895 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG2P55895 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAG2P55895 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAG2P55895 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG2P55895 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAG2P55895 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG2P55895 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAG2P55895 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAG2P55895 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAG2P55895 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG2P55895 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAG2P55895 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG2P55895 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG2P55895 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAG2P55895 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG2P55895 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG2P55895 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG2P55895 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAG2P55895 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAG2P55895 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG2P55895 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG2P55895 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG2P55895 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAG2P55895 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG2P55895 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG2P55895 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG2P55895 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAG2P55895 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAG2P55895 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG2P55895 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAG2P55895 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG2P55895 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAG2P55895 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG2P55895 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAG2P55895 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAG2P55895 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAG2P55895 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAG2P55895 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAG2P55895 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAG2P55895 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAG2P55895 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAG2P55895 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAG2P55895 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAG2P55895 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAG2P55895 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAG2P55895 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAG2P55895 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms