Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MFAP4P55083 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFAP4P55083 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MFAP4P55083 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFAP4P55083 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFAP4P55083 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MFAP4P55083 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFAP4P55083 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MFAP4P55083 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MFAP4P55083 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MFAP4P55083 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFAP4P55083 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MFAP4P55083 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MFAP4P55083 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MFAP4P55083 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFAP4P55083 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFAP4P55083 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFAP4P55083 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFAP4P55083 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFAP4P55083 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms