Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX2-5P52952 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-5P52952 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-5P52952 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-5P52952 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-5P52952 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKX2-5P52952 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-5P52952 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-5P52952 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX2-5P52952 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX2-5P52952 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-5P52952 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-5P52952 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-5P52952 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-5P52952 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-5P52952 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NKX2-5P52952 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-5P52952 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-5P52952 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-5P52952 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-5P52952 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-5P52952 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-5P52952 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-5P52952 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NKX2-5P52952 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-5P52952 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NKX2-5P52952 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-5P52952 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-5P52952 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-5P52952 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX2-5P52952 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX2-5P52952 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX2-5P52952 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX2-5P52952 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-5P52952 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX2-5P52952 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX2-5P52952 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX2-5P52952 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX2-5P52952 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX2-5P52952 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX2-5P52952 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms