Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LUMP51884 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LUMP51884 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LUMP51884 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LUMP51884 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LUMP51884 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LUMP51884 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LUMP51884 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LUMP51884 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LUMP51884 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LUMP51884 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LUMP51884 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LUMP51884 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LUMP51884 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LUMP51884 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LUMP51884 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LUMP51884 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LUMP51884 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LUMP51884 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LUMP51884 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LUMP51884 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LUMP51884 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LUMP51884 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LUMP51884 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LUMP51884 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LUMP51884 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LUMP51884 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LUMP51884 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LUMP51884 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LUMP51884 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LUMP51884 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LUMP51884 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LUMP51884 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LUMP51884 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LUMP51884 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LUMP51884 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LUMP51884 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LUMP51884 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LUMP51884 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LUMP51884 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LUMP51884 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LUMP51884 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LUMP51884 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LUMP51884 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LUMP51884 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LUMP51884 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LUMP51884 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LUMP51884 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LUMP51884 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LUMP51884 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LUMP51884 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LUMP51884 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LUMP51884 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LUMP51884 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LUMP51884 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LUMP51884 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LUMP51884 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LUMP51884 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LUMP51884 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LUMP51884 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LUMP51884 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LUMP51884 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LUMP51884 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LUMP51884 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LUMP51884 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LUMP51884 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LUMP51884 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LUMP51884 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LUMP51884 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LUMP51884 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LUMP51884 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LUMP51884 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LUMP51884 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LUMP51884 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LUMP51884 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LUMP51884 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LUMP51884 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LUMP51884 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LUMP51884 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LUMP51884 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LUMP51884 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LUMP51884 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LUMP51884 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LUMP51884 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LUMP51884 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LUMP51884 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LUMP51884 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LUMP51884 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LUMP51884 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LUMP51884 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LUMP51884 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LUMP51884 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LUMP51884 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LUMP51884 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LUMP51884 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LUMP51884 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LUMP51884 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LUMP51884 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LUMP51884 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LUMP51884 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms