Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA13P48723 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA13P48723 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA13P48723 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA13P48723 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA13P48723 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA13P48723 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA13P48723 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA13P48723 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA13P48723 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA13P48723 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA13P48723 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA13P48723 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSPA13P48723 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA13P48723 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA13P48723 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA13P48723 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA13P48723 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSPA13P48723 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSPA13P48723 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSPA13P48723 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSPA13P48723 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HSPA13P48723 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSPA13P48723 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSPA13P48723 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSPA13P48723 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA13P48723 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSPA13P48723 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSPA13P48723 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HSPA13P48723 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPA13P48723 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA13P48723 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPA13P48723 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA13P48723 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPA13P48723 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPA13P48723 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPA13P48723 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPA13P48723 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSPA13P48723 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSPA13P48723 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSPA13P48723 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSPA13P48723 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HSPA13P48723 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSPA13P48723 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSPA13P48723 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSPA13P48723 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HSPA13P48723 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HSPA13P48723 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HSPA13P48723 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HSPA13P48723 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA13P48723 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HSPA13P48723 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HSPA13P48723 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HSPA13P48723 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HSPA13P48723 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HSPA13P48723 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HSPA13P48723 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HSPA13P48723 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HSPA13P48723 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSPA13P48723 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms