Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP13P45452 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP13P45452 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MMP13P45452 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP13P45452 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP13P45452 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP13P45452 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP13P45452 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP13P45452 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MMP13P45452 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MMP13P45452 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MMP13P45452 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MMP13P45452 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP13P45452 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP13P45452 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MMP13P45452 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP13P45452 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MMP13P45452 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP13P45452 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP13P45452 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP13P45452 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP13P45452 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP13P45452 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP13P45452 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MMP13P45452 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MMP13P45452 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP13P45452 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MMP13P45452 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MMP13P45452 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MMP13P45452 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MMP13P45452 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MMP13P45452 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP13P45452 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP13P45452 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MMP13P45452 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP13P45452 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP13P45452 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP13P45452 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MMP13P45452 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MMP13P45452 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MMP13P45452 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP13P45452 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MMP13P45452 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP13P45452 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MMP13P45452 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP13P45452 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MMP13P45452 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MMP13P45452 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP13P45452 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP13P45452 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MMP13P45452 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMP13P45452 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MMP13P45452 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MMP13P45452 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MMP13P45452 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MMP13P45452 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MMP13P45452 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MMP13P45452 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MMP13P45452 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MMP13P45452 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MMP13P45452 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MMP13P45452 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MMP13P45452 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMP13P45452 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMP13P45452 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMP13P45452 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP13P45452 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MMP13P45452 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP13P45452 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP13P45452 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MMP13P45452 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MMP13P45452 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MMP13P45452 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP13P45452 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP13P45452 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP13P45452 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP13P45452 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP13P45452 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP13P45452 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP13P45452 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP13P45452 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP13P45452 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP13P45452 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MMP13P45452 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP13P45452 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP13P45452 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP13P45452 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP13P45452 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP13P45452 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP13P45452 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP13P45452 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP13P45452 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP13P45452 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP13P45452 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP13P45452 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP13P45452 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP13P45452 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP13P45452 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP13P45452 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP13P45452 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms