Protein–RNA interactions for Protein: P43362

MAGEA9, Melanoma-associated antigen 9, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA9P43362 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MAGEA9P43362 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MAGEA9P43362 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MAGEA9P43362 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
MAGEA9P43362 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MAGEA9P43362 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MAGEA9P43362 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MAGEA9P43362 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MAGEA9P43362 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MAGEA9P43362 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MAGEA9P43362 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MAGEA9P43362 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MAGEA9P43362 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MAGEA9P43362 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MAGEA9P43362 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MAGEA9P43362 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MAGEA9P43362 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MAGEA9P43362 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MAGEA9P43362 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MAGEA9P43362 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
MAGEA9P43362 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAGEA9P43362 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAGEA9P43362 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAGEA9P43362 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAGEA9P43362 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAGEA9P43362 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAGEA9P43362 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MAGEA9P43362 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MAGEA9P43362 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MAGEA9P43362 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAGEA9P43362 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAGEA9P43362 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MAGEA9P43362 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MAGEA9P43362 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MAGEA9P43362 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MAGEA9P43362 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MAGEA9P43362 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MAGEA9P43362 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MAGEA9P43362 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MAGEA9P43362 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MAGEA9P43362 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MAGEA9P43362 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAGEA9P43362 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MAGEA9P43362 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MAGEA9P43362 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MAGEA9P43362 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MAGEA9P43362 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MAGEA9P43362 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MAGEA9P43362 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAGEA9P43362 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MAGEA9P43362 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAGEA9P43362 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAGEA9P43362 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MAGEA9P43362 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MAGEA9P43362 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MAGEA9P43362 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MAGEA9P43362 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MAGEA9P43362 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MAGEA9P43362 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MAGEA9P43362 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MAGEA9P43362 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MAGEA9P43362 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MAGEA9P43362 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MAGEA9P43362 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MAGEA9P43362 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MAGEA9P43362 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MAGEA9P43362 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
MAGEA9P43362 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MAGEA9P43362 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAGEA9P43362 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAGEA9P43362 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAGEA9P43362 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAGEA9P43362 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MAGEA9P43362 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAGEA9P43362 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAGEA9P43362 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MAGEA9P43362 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAGEA9P43362 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAGEA9P43362 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms