Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPCAL1P37235 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HPCAL1P37235 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPCAL1P37235 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPCAL1P37235 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HPCAL1P37235 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPCAL1P37235 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPCAL1P37235 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL1P37235 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPCAL1P37235 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL1P37235 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPCAL1P37235 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL1P37235 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPCAL1P37235 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPCAL1P37235 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPCAL1P37235 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPCAL1P37235 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HPCAL1P37235 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPCAL1P37235 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPCAL1P37235 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPCAL1P37235 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPCAL1P37235 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPCAL1P37235 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPCAL1P37235 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPCAL1P37235 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPCAL1P37235 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HPCAL1P37235 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPCAL1P37235 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HPCAL1P37235 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HPCAL1P37235 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPCAL1P37235 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HPCAL1P37235 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPCAL1P37235 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HPCAL1P37235 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPCAL1P37235 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPCAL1P37235 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HPCAL1P37235 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HPCAL1P37235 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HPCAL1P37235 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HPCAL1P37235 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPCAL1P37235 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPCAL1P37235 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPCAL1P37235 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPCAL1P37235 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPCAL1P37235 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPCAL1P37235 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPCAL1P37235 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPCAL1P37235 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPCAL1P37235 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPCAL1P37235 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPCAL1P37235 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms