Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMB4P28070 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMB4P28070 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMB4P28070 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSMB4P28070 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMB4P28070 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSMB4P28070 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMB4P28070 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMB4P28070 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSMB4P28070 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSMB4P28070 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSMB4P28070 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSMB4P28070 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSMB4P28070 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSMB4P28070 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB4P28070 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB4P28070 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB4P28070 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSMB4P28070 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSMB4P28070 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMB4P28070 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSMB4P28070 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSMB4P28070 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSMB4P28070 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSMB4P28070 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSMB4P28070 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMB4P28070 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMB4P28070 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMB4P28070 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMB4P28070 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMB4P28070 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMB4P28070 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMB4P28070 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMB4P28070 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMB4P28070 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMB4P28070 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMB4P28070 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMB4P28070 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMB4P28070 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMB4P28070 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMB4P28070 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMB4P28070 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMB4P28070 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMB4P28070 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMB4P28070 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMB4P28070 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMB4P28070 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMB4P28070 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB4P28070 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms