Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSMA5P28066 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSMA5P28066 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PSMA5P28066 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PSMA5P28066 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PSMA5P28066 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PSMA5P28066 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PSMA5P28066 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PSMA5P28066 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PSMA5P28066 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PSMA5P28066 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PSMA5P28066 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PSMA5P28066 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSMA5P28066 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PSMA5P28066 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PSMA5P28066 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PSMA5P28066 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PSMA5P28066 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PSMA5P28066 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PSMA5P28066 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PSMA5P28066 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PSMA5P28066 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PSMA5P28066 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PSMA5P28066 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PSMA5P28066 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PSMA5P28066 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSMA5P28066 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PSMA5P28066 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PSMA5P28066 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSMA5P28066 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSMA5P28066 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSMA5P28066 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PSMA5P28066 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PSMA5P28066 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSMA5P28066 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PSMA5P28066 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PSMA5P28066 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSMA5P28066 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSMA5P28066 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PSMA5P28066 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PSMA5P28066 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PSMA5P28066 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PSMA5P28066 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSMA5P28066 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PSMA5P28066 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms