Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSMB9P28065 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB9P28065 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSMB9P28065 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSMB9P28065 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSMB9P28065 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSMB9P28065 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSMB9P28065 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMB9P28065 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSMB9P28065 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMB9P28065 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSMB9P28065 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSMB9P28065 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMB9P28065 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMB9P28065 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMB9P28065 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMB9P28065 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMB9P28065 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMB9P28065 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMB9P28065 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMB9P28065 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB9P28065 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMB9P28065 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB9P28065 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB9P28065 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMB9P28065 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB9P28065 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB9P28065 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB9P28065 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMB9P28065 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMB9P28065 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB9P28065 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB9P28065 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB9P28065 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB9P28065 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB9P28065 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB9P28065 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB9P28065 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB9P28065 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB9P28065 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB9P28065 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMB9P28065 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMB9P28065 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMB9P28065 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMB9P28065 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMB9P28065 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMB9P28065 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMB9P28065 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB9P28065 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMB9P28065 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMB9P28065 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms