Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNCP24821 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNCP24821 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNCP24821 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNCP24821 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNCP24821 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNCP24821 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNCP24821 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNCP24821 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNCP24821 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNCP24821 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNCP24821 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNCP24821 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNCP24821 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNCP24821 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNCP24821 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNCP24821 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNCP24821 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNCP24821 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNCP24821 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNCP24821 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNCP24821 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNCP24821 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNCP24821 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNCP24821 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNCP24821 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNCP24821 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNCP24821 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNCP24821 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNCP24821 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNCP24821 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNCP24821 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNCP24821 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNCP24821 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNCP24821 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNCP24821 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNCP24821 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNCP24821 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNCP24821 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNCP24821 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNCP24821 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNCP24821 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNCP24821 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNCP24821 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNCP24821 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNCP24821 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNCP24821 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNCP24821 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNCP24821 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNCP24821 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNCP24821 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNCP24821 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNCP24821 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNCP24821 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNCP24821 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNCP24821 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNCP24821 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNCP24821 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNCP24821 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNCP24821 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNCP24821 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNCP24821 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNCP24821 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNCP24821 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNCP24821 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNCP24821 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNCP24821 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNCP24821 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNCP24821 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNCP24821 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNCP24821 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNCP24821 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNCP24821 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNCP24821 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNCP24821 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNCP24821 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNCP24821 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNCP24821 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNCP24821 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNCP24821 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNCP24821 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNCP24821 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNCP24821 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNCP24821 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNCP24821 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNCP24821 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNCP24821 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNCP24821 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNCP24821 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNCP24821 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNCP24821 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNCP24821 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNCP24821 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNCP24821 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNCP24821 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNCP24821 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNCP24821 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNCP24821 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNCP24821 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNCP24821 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms