Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPP1P10451 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPP1P10451 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPP1P10451 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPP1P10451 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPP1P10451 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPP1P10451 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPP1P10451 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPP1P10451 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPP1P10451 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPP1P10451 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPP1P10451 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPP1P10451 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPP1P10451 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPP1P10451 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPP1P10451 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPP1P10451 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPP1P10451 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPP1P10451 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPP1P10451 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPP1P10451 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPP1P10451 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPP1P10451 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPP1P10451 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPP1P10451 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPP1P10451 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPP1P10451 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPP1P10451 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPP1P10451 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPP1P10451 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPP1P10451 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPP1P10451 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPP1P10451 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPP1P10451 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPP1P10451 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPP1P10451 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPP1P10451 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPP1P10451 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPP1P10451 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPP1P10451 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPP1P10451 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPP1P10451 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPP1P10451 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPP1P10451 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPP1P10451 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPP1P10451 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPP1P10451 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPP1P10451 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPP1P10451 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPP1P10451 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPP1P10451 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPP1P10451 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPP1P10451 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPP1P10451 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPP1P10451 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPP1P10451 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPP1P10451 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPP1P10451 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPP1P10451 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPP1P10451 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPP1P10451 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPP1P10451 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPP1P10451 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPP1P10451 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPP1P10451 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPP1P10451 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPP1P10451 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPP1P10451 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPP1P10451 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPP1P10451 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPP1P10451 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPP1P10451 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPP1P10451 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPP1P10451 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPP1P10451 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPP1P10451 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPP1P10451 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPP1P10451 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPP1P10451 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPP1P10451 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPP1P10451 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPP1P10451 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPP1P10451 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPP1P10451 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPP1P10451 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPP1P10451 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPP1P10451 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPP1P10451 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPP1P10451 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPP1P10451 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPP1P10451 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPP1P10451 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPP1P10451 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPP1P10451 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPP1P10451 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPP1P10451 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPP1P10451 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPP1P10451 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPP1P10451 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPP1P10451 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms