Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACAA1P09110 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACAA1P09110 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACAA1P09110 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACAA1P09110 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACAA1P09110 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACAA1P09110 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACAA1P09110 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAA1P09110 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACAA1P09110 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACAA1P09110 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACAA1P09110 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACAA1P09110 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACAA1P09110 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAA1P09110 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACAA1P09110 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACAA1P09110 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACAA1P09110 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACAA1P09110 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACAA1P09110 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAA1P09110 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACAA1P09110 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACAA1P09110 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACAA1P09110 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACAA1P09110 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACAA1P09110 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACAA1P09110 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACAA1P09110 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACAA1P09110 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACAA1P09110 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACAA1P09110 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACAA1P09110 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACAA1P09110 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACAA1P09110 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACAA1P09110 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACAA1P09110 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACAA1P09110 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACAA1P09110 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACAA1P09110 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms