Protein–RNA interactions for Protein: P08708

RPS17, 40S ribosomal protein S17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P08708 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS17P08708 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS17P08708 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS17P08708 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS17P08708 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS17P08708 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS17P08708 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS17P08708 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS17P08708 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS17P08708 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS17P08708 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS17P08708 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS17P08708 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS17P08708 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS17P08708 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS17P08708 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS17P08708 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS17P08708 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS17P08708 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS17P08708 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS17P08708 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS17P08708 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS17P08708 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS17P08708 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS17P08708 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS17P08708 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS17P08708 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS17P08708 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS17P08708 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS17P08708 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS17P08708 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS17P08708 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS17P08708 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS17P08708 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS17P08708 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS17P08708 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPS17P08708 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS17P08708 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS17P08708 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS17P08708 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS17P08708 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS17P08708 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS17P08708 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS17P08708 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS17P08708 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS17P08708 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS17P08708 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS17P08708 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS17P08708 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS17P08708 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS17P08708 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS17P08708 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS17P08708 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS17P08708 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS17P08708 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS17P08708 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS17P08708 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS17P08708 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS17P08708 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS17P08708 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPS17P08708 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS17P08708 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS17P08708 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS17P08708 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPS17P08708 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS17P08708 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPS17P08708 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS17P08708 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS17P08708 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPS17P08708 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPS17P08708 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS17P08708 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS17P08708 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS17P08708 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPS17P08708 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS17P08708 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPS17P08708 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS17P08708 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPS17P08708 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS17P08708 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS17P08708 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS17P08708 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPS17P08708 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS17P08708 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS17P08708 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS17P08708 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPS17P08708 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RPS17P08708 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPS17P08708 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS17P08708 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPS17P08708 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS17P08708 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPS17P08708 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPS17P08708 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS17P08708 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS17P08708 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPS17P08708 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS17P08708 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPS17P08708 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPS17P08708 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms