Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MGPP08493 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MGPP08493 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MGPP08493 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MGPP08493 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MGPP08493 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MGPP08493 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MGPP08493 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MGPP08493 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MGPP08493 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MGPP08493 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MGPP08493 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MGPP08493 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MGPP08493 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MGPP08493 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MGPP08493 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MGPP08493 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MGPP08493 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MGPP08493 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MGPP08493 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MGPP08493 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MGPP08493 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MGPP08493 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MGPP08493 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MGPP08493 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MGPP08493 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MGPP08493 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MGPP08493 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MGPP08493 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MGPP08493 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MGPP08493 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MGPP08493 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MGPP08493 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MGPP08493 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MGPP08493 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MGPP08493 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MGPP08493 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MGPP08493 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MGPP08493 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MGPP08493 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MGPP08493 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MGPP08493 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MGPP08493 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MGPP08493 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MGPP08493 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MGPP08493 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MGPP08493 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MGPP08493 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGPP08493 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGPP08493 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MGPP08493 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MGPP08493 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MGPP08493 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGPP08493 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGPP08493 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MGPP08493 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MGPP08493 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MGPP08493 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MGPP08493 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MGPP08493 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MGPP08493 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MGPP08493 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MGPP08493 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGPP08493 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGPP08493 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MGPP08493 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MGPP08493 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MGPP08493 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MGPP08493 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MGPP08493 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MGPP08493 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MGPP08493 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGPP08493 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MGPP08493 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGPP08493 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGPP08493 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MGPP08493 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MGPP08493 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MGPP08493 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MGPP08493 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MGPP08493 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MGPP08493 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MGPP08493 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MGPP08493 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MGPP08493 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MGPP08493 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MGPP08493 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MGPP08493 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MGPP08493 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MGPP08493 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MGPP08493 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MGPP08493 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MGPP08493 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MGPP08493 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MGPP08493 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MGPP08493 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MGPP08493 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGPP08493 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MGPP08493 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MGPP08493 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms