Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFTPBP07988 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPBP07988 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPBP07988 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPBP07988 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPBP07988 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPBP07988 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPBP07988 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPBP07988 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPBP07988 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPBP07988 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPBP07988 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPBP07988 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPBP07988 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPBP07988 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPBP07988 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPBP07988 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPBP07988 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPBP07988 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPBP07988 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPBP07988 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPBP07988 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPBP07988 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFTPBP07988 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFTPBP07988 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SFTPBP07988 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFTPBP07988 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFTPBP07988 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFTPBP07988 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms